显微外科手术近年来，随着显微神经外科的发展，越来越多的学者将积极的开颅手术、争取全切除作为松果体区肿瘤的首选治疗方法。运用显微外科技术直接手术切除松果体区肿瘤已被越来越多的神经外科医生所接受，手术死亡率较十年前有了明显的下降，大宗病例报道手术死亡率已降至2．6％。目前国际上较为一致的松果体区肿瘤的治疗原则是：对除了术前影像学资料比较肯定地支持生殖细胞瘤诊断的患者先行放疗，其他的患者均直接手术。我们只是对那些在MRI上肿瘤沿第三脑室扩展和(或)鞍区同时有肿瘤存在的患者才考虑为生殖细胞瘤的可能，先行诊断性放射治疗。其余的松果体区肿瘤患者均选择首先行手术切除肿瘤。在良好的显微神经外科技术支持下，并发症常以短暂者居多，且对患者的生活质量及预后不会造成特别大的影响。赵寅涛等利用显微外科技术处理15例松果体区及幕镰区肿瘤，结果肿瘤全切9例占73．33％，次全切除2例占13．33％，死亡例占6．67％。
立体定向放射外科治疗立体定向技术的发展为源于松果体区肿瘤的诊断和治疗开阔了广大前景，它不仅能安全可靠地获得病理学诊断(立体定向活检的死亡率已降至O％一．3％，诊断正确率为90％以上)，而且与放射神经外科相结合，成为松果体区病变较有前途的治疗手段。Dempsey等报道立体定向活检和立体定向放射外科治疗的47例中，仅1例隐匿性脑动静脉畸形患者需要求助于神经外科手术治疗，跟踪2年以上均见病变消失或控制生长。Leopoldo等报道了立体定向放射神经外科与外放射治疗相结合治疗颅内生殖细胞瘤，认为直径小于30mm的生殖细胞瘤用伽玛刀治疗能使之在一周或更短时间内明显缩小或消失，同时还能够减少外放射治疗的照射剂量。跟踪4年患者状态良好，无肿瘤复发。对于混合型生殖细胞瘤，立体定向活检不能提供有效的肿瘤组织样本，会导致诊断错误和治疗效果不理想。此外，有些已经行立体定向活检术的病人根据病理诊断可能需要再行开放手术切除肿瘤，再次手术增加了手术危险性。对于合并梗阻性脑积水的病人，在行脑内镜活检术的同时可作第三脑室造瘘术。如果肿瘤对放疗敏感或者肿瘤标记物(血清或脑脊液提示为生殖细胞瘤时，可采用立体定向活检术。对于肿瘤为多发的或已经扩散的病人，则应避免采用开放手术。
内窥镜辅助手术可利用内窥镜辅助观察显微镜直视术野以外的死角，主要适用于颅底及脑深部病变的各种显微手术。由于神经内窥镜的应用，有学者提倡对于松果体区肿瘤的治疗分两步进行：第一步，神经内窥镜下缩小肿瘤体积，作大体形态分析和组织学诊断，并行第三脑室造口术，解除梗阻性脑积水；神经内镜下第三脑室造瘘对梗阻性脑积水是一个相对新的治疗方法，似乎在安全和方便方面比立体定向第三脑室造瘘更具优越性，神经内镜下第三脑室造瘘能像标准的分流那样做到有效而迅速地减轻颅内压增高，通过第三脑室底开窗，脑脊液的生理循环得以恢复，颅内压增高得以立即消除，特别是对松果体恶性肿瘤的治疗有时具有重要意义。第二步，根据病理诊断决定相应的治疗方案。病理学诊断非常重要，它可明确需要何种辅助治疗。例如生殖细胞瘤对放疗特别敏感而手术切除则没有什么效果；良性畸胎瘤和脑膜瘤手术切除可以得到治愈，而放疗和化疗效果很差；松果体区低级别神经胶质瘤可以通过手术切除达到治疗目的，而高级别神经胶质瘤则需要在术后继续放疗和化疗。
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