在繁复的检查中，最让人害羞的，恐怕还是“肛门指检”。肛内指检就是我们日常所说的肛门直肠指检，在戴好手套并涂好润滑油后，医生会将食指伸入直肠进行检查。指检分为内检和外检查，肛外指检涉及的范围主要是菊花周边，即医生用食指触及肛门外部，查看菊花周边有无肿物和硬结，并检查肛外的皮下有无瘘管等出现。
指检的具体过程
第一步，清洗双手，佩戴手套
医生在进行手术前均会进行“刷手”，即反复清洗双手。在进行菊花检查之前，医生还会特地使用含有酒精成分的消毒凝胶对双手进行再次清洗，以保证深入私处的检查清洁有效。
第二步，选好姿势，缓解心理压力
一般而言，适用于菊花检查的姿势有三种。
一是膝胸式，此种方法较适用于男性病人，以便附带进行前列腺检查。
二是左侧卧式，像婴儿一样弯曲双膝，双手置于胸前，此方法男女皆可采用。
三是仰卧式，身体虚弱的患者可以采用此种方式，以最大程度减轻患者的不适感。
第三步，润滑食指
为避免病人出现不适或疼痛感，医生会将润滑油（一般是液体石蜡或凡士林）涂抹在手套上，使菊花附近的组织尽量放松。
第四步，指尖旋转跳跃
医生的食指就此在患者的菊花处展开了旋转跳跃式舞蹈，触及的不同情况会指向不同的病症，这也是医生做出诊断的关键。
第五步，移出手指，清洗菊花
医生移出手指后，会观察手套是否会被血染，若有出血情况出现，则需要进一步的诊断。
生活中大部分人都会因为羞赧而放弃肛门的检查，但有数据表明，约有80％的肛管直肠癌可在菊花指检时被发现，而临床上肛管直肠癌被误诊的病人中约有85％往往是未做过认真的肛门指诊。直肠癌在指检时可在肠壁上可摸到高低不平的硬块，其表面可有溃疡，肠腔常狭窄，指套上往往染有脓血和粘液。除了直肠癌还有哪些疾病可以通过肛门指检检查出来呢？
直肠息肉：可摸到质软而可推动的肿块，指套上常染有血迹。
内痔：一般内痔是柔软的，即使摸到也不能分辨其大小和多少，但如有血栓形成，则可摸到光滑的硬结。
肛瘘：可摸到索状物，有时在肛瘘内口可扪到小硬结或凹陷。
肛门直肠周围脓肿：骨盆直肠间隙脓肿及直肠后间隙脓肿，在直肠内可摸到压痛性肿块，表面较光滑。其他间隙脓肿可用拇、食指作双指触诊检查，即食指放在直肠内，拇指放在肛周皮肤上，拇、食指触诊，可以发现肛管前深、后深间隙脓肿、坐骨直肠间隙脓肿或肛周脓肿。
肛乳头瘤：可摸到质地中等而可推动的、长蒂肿物，指套干净。
肛门周围：皮肤病、皮下包块、炎症、脓肿、外痔、肛瘘瘘管。
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