看点:经过数据和文献分析出的肿瘤中和超级增强子相关miRNAs
关键词(分子机制):
Super enhancer:超级增强子,基因上游新发现重要的调控序列。在细胞分化和疾病发生过程中起重要作用。
Super-enhancers are an emerging subclass of regulatory regions controlling cell identity and disease genes.
Cancer Hallmarks: 肿瘤的十大生物学功能
Oncogene:促癌基因
Tumor Suppressive:肿瘤抑制基因
结论:通过癌症/癌旁,超级增强子表达,miRNA表达等三个维度筛选出超级增强子相关miRNAs,进一步通过GO分析miRNAs的功能注释,在TCAG数据库里通过表达差异,生存曲线差异两个维度确定有功能意义的miRNA。最重要的是,将miRNA的功能和癌症的十大生物学功能挂靠。对于理解miRNA在肿瘤生物学的立题以及miRNA真的超级增强子的分析具有理论意义。
结果展示如下:
肿瘤中超级增强子相关miRNA:
A:癌症和癌旁组织差异表达筛选
B:超级增强子相关的miRNAs功能注释统计
C:超级增强子相关的miRNAs功能注释分析
D:超级增强子相关的miRNAs如何挂靠“肿瘤的十大生物学功能”
EF:TCGA数据库超级增强子相关的miRNAsCOX相关性分析
G:TCGA数据库中三种癌症数据的生存曲线分析
材料来源:Cell
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