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Microbiome ▏研究人员在猪身上证实磷虾油可以减弱肠道炎症和调节肠道菌群

时间:2021-11-05 06:55:12

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导读

ω-3多不饱和脂肪酸(PUFA)的抗炎特性已在炎症性肠病(IBD)的治疗中得到了广泛应用。然而,PUFA是否在炎症的解决和促进粘膜愈合方面发挥重要作用尚不清楚。磷虾油(KO)是一种天然产品,富含PUFA和强大的抗氧化剂,虾青素。在本研究中,作者通过体外和体内结肠炎模型以及基于多组学的方法来了解KO调节肠道微生物组和代谢组的机制。本研究为优化微生物激发的IBD治疗替代疗法提供了机制基础。鉴定出的微生物特征,特别是那些对结肠炎表型具有很强预测准确性的微生物,将促进与适当的饮食干预相关的生物标志物的发展,以控制肠道炎症。

论文ID

题目:Mechanistic insights into the attenuation of intestinal inflammation and modulation of the gut microbiome by krill oil using in vitro and in vivo models

译名:在体外和体内模型中使用磷虾油减弱肠道炎症和调节肠道微生物的机制洞察

期刊:Microbiome

IF:10.465

发表时间:.6.4

通讯作者单位:中国海洋大学

DOI号:/10.1186/s40168-020-00843-8

实验内容

首先,作者检测了KO在体外对炎症反应的作用。结果发现KO处理分化的THP1人巨噬细胞显着降低脂多糖(LPS)诱导的IL1蛋白和TNF - mRNA表达,并呈剂量依赖性。基于RNAseq的转录组分析研究了KO与两种抗炎化合物塞来昔布(COX2 inhibitor, CX)和TPCA1 (IKK2 inhibitor)的协同作用。此外,KO与CX或TPCA1联合使用,会比单独使用KO进一步降低促炎基因如IL6、NOD2和CCL2的表达。总之,通过一些列体外数据发现,KO在炎症的初始和前分解阶段都有调节作用,而且它可能具有促进粘膜愈合的特性。

图一:磷虾油在体外通过调节广泛的信号通路减轻炎症反应

Th1/Th2/Th17失衡是结肠炎发病的重要驱动力。最近,通过重新平衡Th1/Th2免疫反应,寄生虫排泄/分泌蛋白的Th2样倾向被用来改善DSS诱导的结肠炎。苏木精和伊红(H&E)染色显示,28天的KO治疗明显改善了猪T.感染引起的结肠组织学损伤。结肠平滑肌厚度和总体组织病理学评分也在KO中略有改善。杯状细胞的数量明显增加,特别是在受感染的动物。一系列实验结果表明磷虾油减轻了Th2驱动的猪结肠炎模型的肠粘膜损伤。

图二:磷虾油减轻了Th2驱动的猪结肠炎模型的肠粘膜损伤

滴虫感染显着降低了猪体内alpha多样性的各种指标,而添加KO的猪则显着提高了两个基于富裕度的指数。与膳食补充剂不同,感染对beta多样性也有显着影响。值得注意的是,喂食KO有助于恢复感染条件下的微生物网络结构。在补充SO或KO的背景下,感染导致厚壁菌门的丰度显着下降,同时拟杆菌门的丰度增加。然而,与感染相关的F/B比率的降低被KO显着改善。在种水平上,饲喂KO的猪阴道乳杆菌丰度也显着降低约3倍。总之,磷虾油部分恢复了猪鞭虫引起的肠道微生物失调。

图三:磷虾油在猪模型中调节了肠道微生物群

总之,该研究了补充KO对炎症的初始阶段和缓解阶段的影响。KO在体外抑制Th1和th17相关细胞因子的表达,促进巨噬细胞的杀菌活性。KO通过增加物种丰富度和调节微生物相互作用,部分恢复了感染诱导结肠炎模型中的微生物生态失调。此外,KO对宿主和微生物组氨酸代谢关键代谢物的抑制作用有助于其抗炎活性。未来的方向将包括探索KO与传统小分子药物的协同作用,促进肠道炎症的适当解决。

原文链接

/10.1186/s40168-020-00843-8

参考文献

1. Plichta DR, Graham DB, Subramanian S, Xavier RJ. Therapeutic opportunities in inflammatory bowel disease: mechanistic dissection of host-microbiome relationships. Cell. ;178(5):1041–56

网络精讲班预览

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培训简介

人体胃肠道有超过10万亿细菌,它们被称为人类的第二大基因组——肠道菌群。近年年来,随着分⼦生物学、基因组学、生物信息分析技术、高通量测序技术的高速发展,肠道菌群研究取得了突飞猛进的发展。越来越多的研究证实肠道菌群与消化、吸收、代谢、免疫等功能密切相关,肠道菌群紊乱与肿瘤、腹泻、肥胖、心脑⾎血管、神经系统等多种疾病密切相关。作为目前最火热的研究方向,几乎各临床⼦学科均可与肠道菌群建⽴关联研究, 同时也受到国内各种自然基金的资助和青睐。国家自然基金以肠道菌群为关键词立项1098 项,资助金额达到49576万元,而且与肠道菌群相关的研究也更易发表高分SCI文章。然而作为一门新兴的研究方向,究竟该如何设计与肠道菌群的相关研究?可以和哪些研究手段进行结合分析?肠道菌群研究的创新点该如何选择?如何读懂高分的微生物研究的套路?.仍然需要进一步的深入了解。因此为了积极备战。为了准备的国家自然科学基金申报与高质量课题的设计,应广大学员的提议,我们决定邀请获得国自然基金资助和从事微生物研究领域多年的四位专家,召开"肠道菌群代谢组学课题设计网络精讲班",欢迎全国科研院所的研究人员报名参加。

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8.吴教授点评学员标书,做手把手地指导学员写标书

讲师简介

专家一:吴教授,国内某高校教授,博士生导师。作为课题负责人先后主持肠道菌群与代谢组学研究国家级课题和部省级课题多项,并先后承担多项973计划课题中有关代谢组学方面的研究课题。所带领的团队主要采用代谢组学、生态学、生物信息学、分子生物学等多种宏观与微观相结合的方法,从宿主代谢与菌群微生态交互作用的角度对胃肠道疾病、神经退行性疾病的菌-肠-脑机制进行研究。目前已发表多篇SCI论文,在肠道菌群、代谢组学数据分析策略等相关领域受到了广泛关注和认可。专家二:国内知名⾼校教授,博⼠⽣导师,曾在海外从事微⽣态与营养健康相关研究10余年,主要涉及肠道炎症反应、⼤肠癌发病机制以及肌⾁和脂肪⼲细胞⽣理的分⼦机制的研究,拥有⽣物医学、分⼦⽣物学、细 胞⽣物学和⽣物化学等⽅⾯深厚的理论研究及实验操作经验。近年来在Journal of Clinical Investigation, Nucleic Acids Research, PNAS, Cell Metabolism, Gastroenterology 等国际权威期刊发表SCI学术论⽂31 篇,总影响因⼦~200,累计参与主持多项国⾃然⾯上⻘年基⾦及美国国⽴卫⽣研究院(NIH)资助的科学研究基⾦,申请发明专利4件,授权软件着作权1件。近年来在中国肠道⼤会、EMBL Conference、中华医学会等⾼⽔平会议进⾏微⽣物领域专题汇报,获得了业界的⼴泛关注和认可。专家三:⻓期专注于⽣物信息学与化学信息学研究,研究⽅向包括基于NGS的微⽣物组学数据分析,⼈⼯智能技术在肠道微⽣物及药物筛选中应⽤,化学/⽣物/中药数据挖掘与可视化,开发多个⽣物信息数据分析平台。在国际权威杂志Bioinformatics, J. Chem. Theory Comput., J. Chem. Inf. Model.等发表⽂章28篇,主持国家、省级项⽬3项,申请发明专利1项,申请软件着作权5个。熟悉肠道菌群多组学数据分析的思路,对微⽣物多样性、宏基因组、代谢组学等⽅向有深刻了解。专家四:⻓年专注于临床⼯作与微⽣物研究结合⽅向,具有丰富的⼀线临床和⼤数据分析经验,熟练掌握微⽣物领域⾼通量测序数据分析平台的搭建及下游数据的深度挖掘。近2年来完成40余项微⽣物数据分析项⽬,参与发表微⽣物领域SCI⽂8篇及专利3项,作为数据分析⼈员参与多项国⾃然⾯上⻘年及省级项⽬。课程内容为全部原创,对此领域的科研思路以及最新研究动态熟悉掌握,尤其擅⻓于将⼀线临床⼯作与微⽣物研究相结合进⾏研究课题设计。

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