这年头
你大爷可能还是你大爷
但你认识的那个GAPDH
可能不再是那个你熟悉的GAPDH了
这不,9月16号肿瘤领域权威杂志《Cancer cell》刊登了题为“GAPDH Overexpression in the T Cell Lineage Promotes Angioimmunoblastic T Cell Lymphoma through an NF-κB-Dependent Mechanism”的学术论文,文章指出我们常用内参GAPDH在T细胞中的过表达可以通过激活NF-κB信号通路促进血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤的生长。
Cancer Cell36, 268–287,
那么问题来了,当你大爷还是你大爷,你熟悉的大妈还是你大妈吗?或者说,你熟悉的内参GAPDH,还可以做内参吗?
文中写道:
GAPDH is overexpressed in many cancers (Chiche et al., ; Liberti et al., ; Revillion et al., 2000), but is role in tumorigenesis is still unclear (Revillion et al., 2000).
2000年的时候人家就说GAPDH在肿瘤中高表达,就像这篇文章的结论,在血管免疫母细胞性淋巴瘤老鼠模型中GAPDH是高表达的。而这样的表达会参与NF-κB通路的激活。基因一旦跟这个通路连上,一定不干好事。下面的故事就都顺理成章了。
大家不要惊慌,GAPDH的促癌功能应该是存在局限于特定模型,或特定肿瘤的。但是由此引起我们的思考,难道只有GAPDH才是最合理的内参吗?我们又应该如何寻找一个合理的内参呢?
如何选择一个合适的内参基因呢?
陈凤花,王琳,胡丽华.实时荧光定量RT-PCR内参基因的选择[J].临床检验杂志,(05):393-395
找到了一篇总结非常好的中文的综述,此文列出来一些内参,文章还讨论一些常见研究使用内参的参考意见。
此外还有一篇文章,推荐给大家。这篇文章讲述了怎么样用实验的方法去筛选一个合适的内参。
本文借鉴于Chris生命科学小站
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