1、产地环境条件
共同点：
生态环境良好、无污染的地区
对空气、用水及土壤中的各项污染物的浓度限值进行了规定。
差 异
注：日平均为任何一日的平均浓度；1h平均为任何一小时的平均浓度；任何一次采样时间为一天3次
农田灌溉水：绿色食品和有机食品基本一致，无公害食品氟化物略高，石油类浓度限值是前两者的2倍。
有机食品基地要求至少3年未使用过任何化学合成物资（转换期），绿色食品和无公害食品未做规定。
2、生产加工要求
（1）有机食品和AA级绿色食品在生产加工过程中绝对禁止使用农药、化肥、激素等人工合成物质，并且不允许使用基因工程技术。通过选择抗病虫品种、实行轮作、人工除草、使用生物农药、培养天敌等生物防治，以及采用物理、机械等综合农业技术措施防治病虫草害。
A级绿色食品和无公害食品可以有限度、选择性使用合成农药，也可以使用由基因工程获得的种子、种苗和微生物菌种。
（2）食品加工
绿色食品根据我国绿色食品操作规程进行生产，有机食品根据国际有机农业运动联合会（IFOAM)标准进行生产。要求加工原料95%来自对应的产地。A级绿色食品可以使用标准规定许可使用的化学合成色素、防腐剂、品质改良剂等，有机食品和AA级绿色食品不允许使用人工合成的添加剂，只能使用天然物质。
3、管理机构
相同点：
采用“技术标准为基础、质量认证为形式、商标管理为手段”的管理模式。并由各级食品安全管理机构、环境监测机构和产品安全质量监督监测机构进行协调管理。
不同点：
绿色食品：农业部绿色食品发展中心，标志使用期限3年。
有机食品：国家环保局有机食品发展中心，使用期限1年。
无公害食品：农业部，标志使用期限尚未规定。
4、产品标准
不同级别检测的农残和重金属的种类不同，限量也不同。其中有机食品和AA级绿色食品限值最低，其次是A级绿色食品，无公害食品限制最高。
但与普通食品比较，检测的项目多，残留量低。
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