自然病程较短，若不治疗，一般多在6个月内死亡，平均病程约3个月。自从应用联合化疗以来，预后有了明显改善。缓解率可达95％以上，目前发达国家如德国ＢＦＭ协作组的五年无病生存率已达到80％，国内的五年无病存活率也达到74％以上。因此ＡＬＬ已成为一种可治愈的恶性肿瘤。
预后与临床分型的评分关系密切。一般认为高危患儿较标危患儿预后差。此外，化疗后达到完全缓解的时间与预后关系密切。诱导治疗后，周围血幼稚细胞在5天内减少一半，骨髓于2周内明显好转，4周内达到完全缓解者，则预后较好。
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