超声内镜（EUS）可以清楚显示食道壁的各层结构、大多数纵膈淋巴腺、胃周淋巴腺、腹腔干淋巴腺以及肝左叶，因而可对食道癌的T、N分期作出精确判断。
临床资料显示食道癌患者手术前行EUS检查能迅速而容易鉴别病变位于食道内还是在壁外，在探测肿瘤范围、浸润的深度上EUS正确率为（90%）明显优于CT（59%）。
EUS对食道癌T分期、N分期的准确性均高于CT。在评价局部淋巴腺转移方面，EUS正确率（70%）也优于CT（50%）。
EUS可判断<5mm直径的淋巴腺。EUS能分辨淋巴腺与血管而确定腹腔动脉有无受到侵犯。外科医生在手术前能获悉腹腔动脉附近淋巴腺有可疑转移，则可先开腹探查，再行开胸手术。
但EUS由于受检查范围及肺脏的影响，判断食道癌M分期的准确性为60%～70%，还不能完全取代CT的作用。
内镜超声检查可因肿瘤堵塞而不能插入受到限制。除此以外，影像面积小，操作换能器以得到靶病灶有足够断面较困难等，为较CT不足之处，目前国内应用尚有限。
超声内镜对于食道癌手术后复发的早期诊断有意义。食道癌手术后复发的症状易被手术后食道的良性狭窄或动力学异常所掩盖；此外，复发的病灶多见于粘膜下或管壁外，所以超声内镜对于食道癌手术后复发的早期诊断优于CT和内镜。
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