母猪繁殖障碍综合症的病因分为先天性、机能性、营养性、机械性和疾病性，其中以传染性疾病危害最大。
一、先天性繁殖障碍
主要表现为生殖器官畸形，妨碍精子和卵子的正常运行，阻碍精于和卵子的结合。常见的生殖器官畸形有卵巢系膜和输卵管系膜囊肿、输卵管阻塞、缺乏子宫角、子宫颈闭锁、双子宫体、双子宫、双阴道。
防治：出现上述临床症状，都是难以治疗的，只有在后备母猪选育过程中进行淘汰，消除畸形基因。
二、机能除繁殖障碍
1.卵巢发育不全
猪的正常卵巢重量为5克左右，发育不全的在3克以下，原因是脑垂体机能障碍，卵巢对性腺激素敏感性降低而引起。
2.卵巢囊肿
主要表现发情不规律，其中青年母猪占一半以上。
治疗措施：肌肉注射促黄体素200至500微克欣，注射1至4次。治疗到发情的间隔时间为22天，发情率一般为百分之77．4，受胎率可达百分之70．2。
3.持久黄体
母猪长期不发情，可用前列腺素使黄体消退，与性腺激素联合使用效果更好。
诊疗方法：先用前列腺素35毫克肌肉注射，经3至5天后阴部肿胀时再注射性腺激素1000单位，大多数在3至4天内发情，配种即可受胎。
4.卵泡发育障碍
包括卵泡机能减退、萎缩及硬化，在不发情母猪中有百分之69为卵泡发育障碍所引起。
治疗方法：可用性腺激素200至1000单位肌肉注射或用绒毛膜促性腺激素500至1000单位，隔1至2天做一次。
三、营养性繁殖障碍
1.能量和蛋白质
高能量饲料使母猪过肥，尤其缺乏运动的情况下，导致肥胖性不育。如能量和蛋白质供应不足，母猪瘦弱，则发情期向后推迟或不发情，卵泡停止发育，安静排卵或形成卵泡囊肿，配种前一周每天给母猪增加饲料，消化能为每公斤12兆焦可获较高胚胎存活率。
2.维生素
Va、Vb、Vd、Ve是母猪维持正常繁殖机能不可缺少的维生素，严重缺乏会影响受胎和胎儿的正常发育。
Va缺乏会使母猪难以受胎、中途流产、产弱仔、育胎、死胎和畸形胎。
Vb1缺乏时母猪屡配不孕，性机能紊乱、发情不正常、产弱仔。Vb2缺乏时母猪泌乳减少，所产的仔猪易形成儒猪。Vb6缺乏时母猪发情推迟。Vbl2缺乏时母猪泌乳量下降，产仔少，易患恶性贫血症。Vb3缺乏时运动失调、鹅步、肠炎、生殖及泌乳机能受损。
Vd缺乏时母猪泌乳量下降，受胎率降低，易患产后瘫痪，表现流产、死胎、脱子宫，仔猪易患佝偻病。
Ve缺乏时会使生殖道上皮角质化，母猪不易受胎，易流产。对公猪扰乱精于形成过程，严重时精液中无精子。
据资料报导：在母猪日粮中添加Va、Vd、Ve对改善繁殖率有良效，可明显缩短从断奶到发情的时间，提高受胎率。
四、机械性繁殖障碍
主要是母猪受外伤而引起胎儿死亡。
五、疾病性繁殖障碍
1.细小病毒病
主要特征取决于在哪个阶段感染该病毒。感染后母猪可能再发情，或既不发情，也不产仔，或窝产仔只有几头，或产出木乃伊胎儿。唯一的症状是在怀孕中期或后期胎儿死亡，胎水被吸收，母猪腹围减小。而其它表现为不孕、流产、死产、新生仔猪死亡和产弱仔。70天后感染可正常产仔，仔猪带毒。
2.钩端旋转体病
该病能引起胎儿死亡、流产和降低仔猪存活率。该病的潜伏期是12周，在怀孕第一个月感染，胎儿一般不受影响。第二个月感染，引起胎儿死亡和重吸收、木乃伊或流产。第三个月感染引起流产、产弱仔。
3.乙型脑炎
除青年母猪以外，其它猪感染后多为亚临床症状，经产母猪血液抗体高，其它无症状。青年母猪的死胎、木乃伊的发生率高达百分之40，新生仔猪死亡率为百分之42。
4.非典型猪瘟
猪体免疫力下降，母猪感染猪瘟病毒常引起繁殖障碍。妊娠10天感染，胚胎死亡和吸收，母猪产仔头数少或返情。妊娠10天至50天感染，死胎多。产前一周感染不影响仔猪存活，但影响发育。后备母猪在配种前两周或一个月免疫猪瘟疫苗，剂量两个头份即可预防非典型猪瘟的发生。
5.鹦鹉热衣原体病
为地方性流行。病猪或潜伏感染猪的排泄物和分泌物均可带毒传染，可危害各种年龄的猪，但对妊娠母猪最敏感，病原可通过胎盘屏障渗透到子宫内，导致胎儿死亡。初产青年母猪的发病率为百分之40至90，而基础母猪往往无恙。发病母猪呼吸困难、体温高、皮肤发紫、不吃或少食。该病可用四环素进行治疗。
6.子宫感染
对母猪做输卵管及子宫检查发现有百分之40至45带菌，最常见的是大肠杆菌和白色葡萄球菌。子宫带菌是由公猪配种时带入(包皮液、精液本身)，也可能来自阴道。子宫带茵对初配母猪的危害最大，总之无论是传染性还是非传染性疾病，能引起母猪体温升高时，都会引起胚胎死亡或流产。
7.猪繁殖呼吸障碍综合症(又称蓝耳病)
母猪表现消瘦、厌食、体温稍有升高，双耳、腹部、乳房发蓝，流产、早产、产出死胎及弱仔。开始发病时以弱仔多为特征，时间长了即出现木乃伊及死胎多的现象。母猪产后无奶，仔猪死亡率最高时可达百分之100。少数猪表现耳尖、鼻尖和四肢末端、尾尖、乳头部、会阴部呈蓝紫色，因此得名为蓝耳病，此种现象呈一过性。
8.猪附红细胞体病
仔猪高烧、黄染、贫血、急性死亡。妊娠后期和产后母猪发生乳房炎、不食、高烧，部分母猪流产或产死胎。
9.弓形体病
妊娠母猪发生了弓形体病会出现流产、死胎及木乃伊胎。
10.猪布氏杆菌病
主要是第一胎母猪发生流产，流产常发生在妊娠第13个月，最早23周，最晚接近分娩时流产。早期流产时母猪可将胎儿胎衣吃掉，不易发现。
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