我们在进行基因的蛋白表达检测的时候,通常的方法是进行western blot以及免疫组化进行检测的。对于这两个实验都是需要提前买抗体进行检测的,但是抗体又贵,如果一个基因检测的结果不好的话,那有可能就要浪费这个抗体了。
所以今天就来介绍一个,在很多癌症当中做了很多基因的免疫组化的数据库: The Human Protein Atlas (网址见文末)
对于某一个蛋白免疫组化的结果呈现,数据库是分成了四个分类来呈现的,分别是:没有检测到、低表达、中表达以及高表达。、
数据库使用
数据库的使用和基因的检索数据库是一样的。我们只需要输入我们想要检索的蛋白名即可。例如我们这里输入:CD36。
对于每一个蛋白的数据结果,数据库提供了多个模块来展示结果。首先我们看到的是一个汇总的界面,这里我们能看到这个蛋白的基本信息。另外,我们可以点击不同的模块来查看不同的结果。这个数据库包括的模块有:组织表达情况、细胞定位情况、病理表达情况以及脑和血液的RNA表达情况。
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