问题补充：
不同分子的根本区别是；不同原子的根本区别是；不同元素的根本区别是．由分子构成的物质，发生物理变化和发生化学变化的本质区别是．
答案：
(答案→)
解析：根据分子、原子、元素的定义和特征分析，分子是保持物质化学性质的一种粒子，原子是化学变化中的最小粒子，元素的同类原子的总称．
不同分子，性质不同，其根本区别是分子结构不同；
不同原子，核电荷数不同，其根本区别是核电荷数不同；
不同元素的根本区别是质子数不同，即核电荷数不同．
由分子构成的物质，发生物理变化和发生化学变化的本质区别是发生物理变化时，构成物质的分子不发生改变，发生化学变化时，构成物质的分子发生改变．
故答案为：分子结构不同； 核电荷数不同； 核电荷数不同． 发生化学变化时，构成物质的分子发生改变．
不同分子的根本区别是；不同原子的根本区别是；不同元素的根本区别是由分子构成的物质 发生物理变化和发生化学变化的本质区别是．
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