基因组数据库相当于一个物种的官网，关心该物种的科学家可以通过访问网站了解物种信息、科研进展、做blast等简单分析、下载基因组数据，基因组数据库最核心的模块是基因组浏览器，可以可视化查看基因结构、变异位点、基因表达等信息。
为什么要搭建基因组数据库
方便共享数据：基因组数据库可以聚合一个物种的所有基因组信息，收集和共享数据；
可视化分析数据：基因组浏览器可以对基因组碱基组成、基因结构、SNP等变异信息、基因表达量等进行可视化的生动展示；
提高您在该领域的知名度和权威性；
基因组数据库数据积累起来之后可以独立发文章。
标准基因组数据库（单个物种）
几乎所有已测序国外机构测序的物种都建立了独立的基因组数据库，比如：水稻、拟南芥、果蝇、小鼠、玉米、家蚕、可可等，还有近期发表的猕猴桃、无油樟。
Figure 1 标准基因组数据库的组成模块
参考网站：猕猴桃基因组数据库
我们推出的标准基因组数据库包含以下模块：
物种信息：介绍该物种的进化地位、特性、科研进展等
基因组信息：介绍基因组大小、组装结果、注释结果、图谱、共线性分析等
FTP服务器：方便下载基因组相关数据
可视化Blast服务器：方便从基因组、CDS、蛋白序列中提取关心的序列
Figure 2猕猴桃基因组数据库首页（一个最简单的示例）
Figure 3 通过网页就可以实现在基因组序列、基因集序列中搜索相似序列
基因组浏览器：基于Gbrowse或Jbrowse的基因组浏览器，可视化查看每一条序列的碱基组成、变异信息（支持重测序结果bam、vcf格式）每一条基因的结构、表达丰度（支持转录组数据）。Demo
Figure 4 通过基因组浏览器查看一段序列的碱基组成、SNP变异
Figure 5 通过基因组浏览器查看一段序列上的基因结构
Figure 6 可以将RNA-Seq、表达芯片的数据导入到基因组浏览器，查看表达丰度
参考价格：标准数据库的参考价格是5W，45个工作日交付。
同科（属）、同类物种基因组数据库（多个物种）
参考数据库：蔷薇科基因组数据库
同一个科属的物种为了比较基因组学研究的方便，也建立了数据库。比如：蔷薇科、柑橘属。相关物种为了功能基因组学的研究方便，建立了基因组数据库。比如：硬木、豆类、作物。
除了为每个物种提供标准数据库的功能外，多个物种数据库还可以提供比较基因组的分析。
Figure 7 蔷薇科基因组数据库
Figure 8 蔷薇科基因组数据库包含的物种
Figure 9物种间共线性分析
附 : 参考数据库列表
单个物种
1.芭蕉基因组
2.棉花基因组
3.可可基因组数据库
4.猕猴桃基因组数据库
5.家蚕基因组数据库
6.假丝酵母基因组数据库
7.玉米基因组数据库
8.石斑鱼基因组数据库
9.果蝇基因组数据库
10.无油樟基因组数据库
11.大鼠基因组数据库
12.海胆基因组数据库
13.酵母基因组数据库
同科、同属或同类
14.蔷薇科物种基因组数据库
15.柑橘属基因组数据库
16.越橘属基因组数据库
同类
17.硬木基因组数据库
18.豆类基因组数据库
19.作物基因组数据库
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